รายละเอียดโครงการวิจัย รหัสโครงการ : MRG5380175 ชื่อโครงการ : การศึกษาความสัมพันธ์ในจีโนมไวด์ระหว่างรีโทรทรานสโพซอนส์ในยีนและการแสดงออกของยีน: ผลกระทบจากดีเอ็นเอเมททิลเลชั่นในไซน์และไลน์ Genome-wide association study between retrotransposons in gene body and gene expression: effects of DNA methylation in SINE and LINE หัวหน้าโครงการ : ชัชวิทย์ อาภรณ์เทวัญ : [งานวิจัยที่เกี่ยวข้อง (3 โครงการ) ] ทีมวิจัย : ชัชวิทย์ อาภรณ์เทวัญ หัวหน้าโครงการ อภิวัฒน์ มุทิรางกูร นักวิจัยที่ปรึกษา วันที่เริ่มโครงการ : 15 มิ.ย. 2553 วัตถุประสงค์ : 1. กดทำการศึกษาแบบจีโนมไวด์ (genome-wide) เพื่อเปรียบเทียบการแสดงออกของยีน (gene expression) โดยศึกษาระดับของ mRNA ระหว่างกลุ่มควบคุม (control group) และกลุ่มทดลอง (experimental group) ที่ได้รับ 5-azacytidine โปรดสังเกตว่า 5-azacytidine เป็นตัวยับยั้งการเกิดเมททิลเลชั่นทำให้หมู่เมททิลของจีโนมของกลุ่มทดลองลดลง ขั้นต่อไปเราจะตรวจสอบสมมุติฐานว่า "Transposable elements (TEs) มีความสัมพันธ์กับการแสดงออกของยีนหรือไม่?" โดยทดสอบสมมุติฐานนี้กับซับแฟมิลี่ (subfamily) ทั้งหมดของ SINE และ LINE ที่อยู่ในตัวยีน (gene body or introns) 2. ทำเหมืองข้อมูล (data mining) เพื่อค้นหา association rules ที่อธิบายการเกิด up/down regulations ที่เป็นผลมาจาก TEs (ดูรายละเอียดใน 3. ระเบียบวิธีวิจัย) สถิติการเปิดชม : 1,109 ครั้ง ดาวน์โหลด : 153 ครั้้ง แจ้งปัญหาการดาวน์โหลดที่นี่ (* หากไม่สามารถดาวน์โหลดได้) รายงานวิจัย ฉบับสมบูรณ์: รายงานวิจัยฉบับสมบูรณ์ (Full Paper) บทคัดย่อ (Abstract) : แสดงบทคัดย่อ เลือกดาวน์โหลดแบบลิงค์ :
